Hans-Jürgen Hörner befasst sich seit den 1980er Jahren mit Themen des Umwelt- und Klimaschutzes vor allem im Hinblick auf die Bedeutung für Kirchengemeinden und kirchliche Einrichtungen. Die Teilnahme an zwei Langzeitfortbildungen zum Öko-Pädagogen und zum kirchlichen Umweltberater qualifizieren den gelernten Dipl.-Sozialpädagogen für dieses Arbeitsfeld. Seit 2002 ist er wesentlich an der Einführung des Kirchlichen Umweltmanagements "Der Grüne Hahn" innerhalb der EKvW und anderer Landeskirchen beteiligt. Seit 2010 ist er Projektleiter dieses Arbeitsbereiches.